Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXD11P31277 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 HGNC:18790-207ENST00000505246 973 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 CDC23-201ENST00000394884 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 EAF2-202ENST00000451944 960 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 STARD13-AS-240ENST00000609608 865 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AC012309.1-203ENST00000585860 965 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 FP565260.4-201ENST00000624081 513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 CHAC2-201ENST00000295304 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HOXD11P31277 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms