Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC8P31273 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC8P31273 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC8P31273 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms