Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXA13P31271 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXA13P31271 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXA13P31271 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms