Protein–RNA interactions for Protein: P29590

PML, Protein PML, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMLP29590 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMLP29590 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMLP29590 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMLP29590 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PMLP29590 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PMLP29590 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMLP29590 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMLP29590 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMLP29590 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMLP29590 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMLP29590 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMLP29590 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMLP29590 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMLP29590 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMLP29590 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMLP29590 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMLP29590 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMLP29590 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMLP29590 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMLP29590 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMLP29590 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMLP29590 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMLP29590 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMLP29590 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMLP29590 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMLP29590 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMLP29590 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMLP29590 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMLP29590 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PMLP29590 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMLP29590 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMLP29590 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMLP29590 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMLP29590 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMLP29590 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMLP29590 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMLP29590 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PMLP29590 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PMLP29590 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PMLP29590 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMLP29590 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMLP29590 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMLP29590 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMLP29590 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMLP29590 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMLP29590 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMLP29590 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMLP29590 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMLP29590 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMLP29590 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMLP29590 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMLP29590 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMLP29590 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMLP29590 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMLP29590 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMLP29590 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMLP29590 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMLP29590 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMLP29590 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMLP29590 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMLP29590 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMLP29590 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMLP29590 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMLP29590 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMLP29590 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMLP29590 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMLP29590 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMLP29590 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMLP29590 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms