Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP1P29466 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP1P29466 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP1P29466 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP1P29466 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP1P29466 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASP1P29466 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP1P29466 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP1P29466 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP1P29466 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP1P29466 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP1P29466 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP1P29466 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP1P29466 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP1P29466 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP1P29466 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP1P29466 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP1P29466 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP1P29466 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP1P29466 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASP1P29466 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASP1P29466 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP1P29466 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP1P29466 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP1P29466 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP1P29466 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP1P29466 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP1P29466 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP1P29466 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP1P29466 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP1P29466 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP1P29466 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP1P29466 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASP1P29466 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP1P29466 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP1P29466 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP1P29466 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP1P29466 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP1P29466 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP1P29466 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP1P29466 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP1P29466 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP1P29466 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP1P29466 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP1P29466 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP1P29466 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP1P29466 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP1P29466 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASP1P29466 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP1P29466 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP1P29466 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP1P29466 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP1P29466 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP1P29466 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASP1P29466 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP1P29466 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP1P29466 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP1P29466 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP1P29466 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP1P29466 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP1P29466 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP1P29466 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP1P29466 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP1P29466 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP1P29466 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP1P29466 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP1P29466 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP1P29466 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP1P29466 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASP1P29466 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP1P29466 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP1P29466 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP1P29466 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP1P29466 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP1P29466 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP1P29466 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP1P29466 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP1P29466 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP1P29466 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP1P29466 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP1P29466 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP1P29466 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP1P29466 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASP1P29466 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASP1P29466 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms