Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CD34P28906 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CD34P28906 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CD34P28906 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD34P28906 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD34P28906 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CD34P28906 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD34P28906 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD34P28906 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD34P28906 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD34P28906 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD34P28906 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD34P28906 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD34P28906 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD34P28906 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD34P28906 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD34P28906 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CD34P28906 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CD34P28906 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CD34P28906 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms