Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD1P28340 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLD1P28340 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
POLD1P28340 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD1P28340 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD1P28340 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD1P28340 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD1P28340 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD1P28340 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD1P28340 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD1P28340 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD1P28340 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLD1P28340 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD1P28340 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD1P28340 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD1P28340 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD1P28340 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD1P28340 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD1P28340 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD1P28340 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD1P28340 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD1P28340 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD1P28340 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD1P28340 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
POLD1P28340 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD1P28340 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD1P28340 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD1P28340 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD1P28340 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD1P28340 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD1P28340 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD1P28340 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
POLD1P28340 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLD1P28340 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD1P28340 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD1P28340 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD1P28340 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD1P28340 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD1P28340 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD1P28340 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD1P28340 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD1P28340 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD1P28340 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLD1P28340 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD1P28340 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD1P28340 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD1P28340 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD1P28340 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD1P28340 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD1P28340 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
POLD1P28340 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
POLD1P28340 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD1P28340 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD1P28340 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD1P28340 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD1P28340 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD1P28340 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD1P28340 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD1P28340 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
POLD1P28340 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD1P28340 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD1P28340 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD1P28340 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD1P28340 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD1P28340 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD1P28340 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD1P28340 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
POLD1P28340 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD1P28340 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD1P28340 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD1P28340 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD1P28340 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD1P28340 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD1P28340 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD1P28340 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD1P28340 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD1P28340 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD1P28340 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
POLD1P28340 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD1P28340 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD1P28340 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD1P28340 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD1P28340 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD1P28340 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLD1P28340 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms