Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX2P28328 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX2P28328 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX2P28328 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PEX2P28328 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PEX2P28328 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX2P28328 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX2P28328 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX2P28328 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX2P28328 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX2P28328 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX2P28328 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX2P28328 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX2P28328 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX2P28328 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PEX2P28328 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX2P28328 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX2P28328 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX2P28328 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX2P28328 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX2P28328 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX2P28328 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX2P28328 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX2P28328 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX2P28328 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX2P28328 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX2P28328 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX2P28328 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PEX2P28328 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PEX2P28328 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PEX2P28328 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PEX2P28328 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX2P28328 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX2P28328 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX2P28328 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX2P28328 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX2P28328 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX2P28328 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX2P28328 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX2P28328 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX2P28328 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PEX2P28328 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX2P28328 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX2P28328 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX2P28328 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX2P28328 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX2P28328 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX2P28328 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX2P28328 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX2P28328 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX2P28328 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX2P28328 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX2P28328 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PEX2P28328 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PEX2P28328 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms