Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK3P27448 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK3P27448 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK3P27448 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK3P27448 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK3P27448 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK3P27448 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK3P27448 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK3P27448 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK3P27448 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK3P27448 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK3P27448 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK3P27448 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARK3P27448 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARK3P27448 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARK3P27448 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK3P27448 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK3P27448 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK3P27448 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK3P27448 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK3P27448 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK3P27448 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK3P27448 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK3P27448 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK3P27448 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK3P27448 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK3P27448 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK3P27448 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK3P27448 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK3P27448 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARK3P27448 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK3P27448 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK3P27448 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK3P27448 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK3P27448 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK3P27448 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK3P27448 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK3P27448 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK3P27448 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARK3P27448 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK3P27448 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK3P27448 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK3P27448 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK3P27448 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK3P27448 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK3P27448 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK3P27448 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK3P27448 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK3P27448 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK3P27448 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK3P27448 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK3P27448 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK3P27448 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARK3P27448 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK3P27448 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK3P27448 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK3P27448 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK3P27448 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK3P27448 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK3P27448 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK3P27448 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK3P27448 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK3P27448 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK3P27448 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARK3P27448 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK3P27448 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK3P27448 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK3P27448 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK3P27448 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MARK3P27448 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms