Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK11BP21127 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK11BP21127 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms