Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2CP19387 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2CP19387 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2CP19387 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
POLR2CP19387 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
POLR2CP19387 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POLR2CP19387 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms