Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF6P18850 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF6P18850 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF6P18850 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF6P18850 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF6P18850 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF6P18850 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6P18850 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6P18850 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6P18850 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6P18850 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6P18850 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6P18850 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6P18850 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6P18850 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6P18850 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6P18850 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6P18850 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6P18850 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF6P18850 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF6P18850 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF6P18850 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF6P18850 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF6P18850 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF6P18850 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF6P18850 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF6P18850 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF6P18850 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF6P18850 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF6P18850 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF6P18850 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF6P18850 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATF6P18850 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6P18850 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6P18850 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6P18850 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6P18850 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6P18850 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6P18850 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6P18850 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6P18850 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6P18850 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6P18850 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6P18850 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6P18850 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATF6P18850 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF6P18850 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF6P18850 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF6P18850 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF6P18850 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF6P18850 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF6P18850 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF6P18850 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF6P18850 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATF6P18850 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF6P18850 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF6P18850 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATF6P18850 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF6P18850 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF6P18850 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF6P18850 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF6P18850 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF6P18850 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF6P18850 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF6P18850 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6P18850 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6P18850 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6P18850 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6P18850 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6P18850 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6P18850 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6P18850 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6P18850 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6P18850 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6P18850 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6P18850 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6P18850 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6P18850 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF6P18850 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6P18850 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6P18850 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6P18850 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6P18850 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6P18850 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6P18850 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6P18850 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6P18850 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6P18850 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6P18850 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6P18850 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6P18850 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6P18850 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF6P18850 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF6P18850 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms