Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJA1P17302 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA1P17302 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA1P17302 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA1P17302 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA1P17302 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA1P17302 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA1P17302 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA1P17302 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA1P17302 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA1P17302 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA1P17302 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA1P17302 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA1P17302 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA1P17302 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJA1P17302 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA1P17302 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA1P17302 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA1P17302 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA1P17302 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GJA1P17302 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA1P17302 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA1P17302 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA1P17302 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA1P17302 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA1P17302 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA1P17302 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA1P17302 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA1P17302 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA1P17302 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA1P17302 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA1P17302 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GJA1P17302 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA1P17302 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA1P17302 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA1P17302 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA1P17302 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA1P17302 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA1P17302 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA1P17302 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GJA1P17302 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA1P17302 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA1P17302 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA1P17302 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA1P17302 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA1P17302 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA1P17302 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA1P17302 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA1P17302 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA1P17302 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA1P17302 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA1P17302 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA1P17302 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA1P17302 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA1P17302 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GJA1P17302 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA1P17302 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA1P17302 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA1P17302 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA1P17302 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA1P17302 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA1P17302 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GJA1P17302 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA1P17302 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA1P17302 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA1P17302 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA1P17302 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA1P17302 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA1P17302 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA1P17302 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA1P17302 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA1P17302 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA1P17302 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GJA1P17302 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA1P17302 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA1P17302 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA1P17302 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA1P17302 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA1P17302 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA1P17302 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA1P17302 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GJA1P17302 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA1P17302 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA1P17302 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA1P17302 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA1P17302 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GJA1P17302 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA1P17302 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA1P17302 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
GJA1P17302 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA1P17302 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA1P17302 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GJA1P17302 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms