Protein–RNA interactions for Protein: P17081

RHOQ, Rho-related GTP-binding protein RhoQ, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOQP17081 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RHOQP17081 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RHOQP17081 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RHOQP17081 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOQP17081 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOQP17081 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOQP17081 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOQP17081 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOQP17081 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOQP17081 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOQP17081 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOQP17081 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOQP17081 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOQP17081 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOQP17081 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOQP17081 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RHOQP17081 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOQP17081 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOQP17081 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOQP17081 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOQP17081 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOQP17081 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOQP17081 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOQP17081 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOQP17081 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOQP17081 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOQP17081 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOQP17081 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RHOQP17081 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOQP17081 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOQP17081 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOQP17081 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOQP17081 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOQP17081 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOQP17081 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOQP17081 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOQP17081 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RHOQP17081 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOQP17081 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOQP17081 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOQP17081 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOQP17081 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOQP17081 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOQP17081 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOQP17081 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOQP17081 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOQP17081 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOQP17081 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RHOQP17081 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOQP17081 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOQP17081 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOQP17081 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOQP17081 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOQP17081 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOQP17081 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOQP17081 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOQP17081 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOQP17081 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOQP17081 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOQP17081 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOQP17081 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RHOQP17081 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOQP17081 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOQP17081 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOQP17081 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOQP17081 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOQP17081 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOQP17081 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RHOQP17081 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms