Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPCAMP16422 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPCAMP16422 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPCAMP16422 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPCAMP16422 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPCAMP16422 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EPCAMP16422 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPCAMP16422 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPCAMP16422 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EPCAMP16422 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPCAMP16422 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPCAMP16422 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPCAMP16422 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPCAMP16422 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EPCAMP16422 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPCAMP16422 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms