Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB1P16220 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB1P16220 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB1P16220 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB1P16220 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB1P16220 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB1P16220 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB1P16220 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB1P16220 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB1P16220 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB1P16220 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB1P16220 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB1P16220 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB1P16220 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB1P16220 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB1P16220 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB1P16220 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB1P16220 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB1P16220 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB1P16220 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB1P16220 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB1P16220 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB1P16220 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB1P16220 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB1P16220 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CREB1P16220 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB1P16220 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CREB1P16220 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CREB1P16220 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB1P16220 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB1P16220 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB1P16220 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB1P16220 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB1P16220 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB1P16220 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB1P16220 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB1P16220 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB1P16220 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB1P16220 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CREB1P16220 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB1P16220 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB1P16220 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB1P16220 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB1P16220 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB1P16220 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB1P16220 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB1P16220 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CREB1P16220 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB1P16220 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB1P16220 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB1P16220 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB1P16220 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB1P16220 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB1P16220 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB1P16220 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB1P16220 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB1P16220 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB1P16220 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB1P16220 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB1P16220 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB1P16220 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CREB1P16220 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB1P16220 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB1P16220 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB1P16220 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB1P16220 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB1P16220 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CREB1P16220 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms