Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHN1P15882 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHN1P15882 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHN1P15882 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHN1P15882 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHN1P15882 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHN1P15882 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHN1P15882 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHN1P15882 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHN1P15882 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHN1P15882 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHN1P15882 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHN1P15882 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHN1P15882 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHN1P15882 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHN1P15882 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHN1P15882 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHN1P15882 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHN1P15882 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHN1P15882 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHN1P15882 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHN1P15882 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHN1P15882 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHN1P15882 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHN1P15882 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHN1P15882 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHN1P15882 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHN1P15882 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHN1P15882 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHN1P15882 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHN1P15882 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHN1P15882 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHN1P15882 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHN1P15882 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHN1P15882 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHN1P15882 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHN1P15882 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHN1P15882 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHN1P15882 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHN1P15882 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHN1P15882 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHN1P15882 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHN1P15882 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHN1P15882 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHN1P15882 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHN1P15882 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHN1P15882 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHN1P15882 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHN1P15882 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHN1P15882 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHN1P15882 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHN1P15882 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHN1P15882 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHN1P15882 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHN1P15882 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHN1P15882 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHN1P15882 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHN1P15882 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHN1P15882 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHN1P15882 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHN1P15882 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHN1P15882 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHN1P15882 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHN1P15882 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHN1P15882 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHN1P15882 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHN1P15882 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHN1P15882 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHN1P15882 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHN1P15882 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHN1P15882 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHN1P15882 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHN1P15882 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHN1P15882 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHN1P15882 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHN1P15882 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHN1P15882 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHN1P15882 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHN1P15882 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHN1P15882 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHN1P15882 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms