Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HARSP12081 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HARSP12081 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HARSP12081 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HARSP12081 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HARSP12081 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HARSP12081 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HARSP12081 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HARSP12081 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HARSP12081 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HARSP12081 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HARSP12081 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HARSP12081 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HARSP12081 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HARSP12081 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HARSP12081 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HARSP12081 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HARSP12081 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HARSP12081 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HARSP12081 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HARSP12081 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HARSP12081 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HARSP12081 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HARSP12081 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HARSP12081 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HARSP12081 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HARSP12081 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HARSP12081 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HARSP12081 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HARSP12081 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HARSP12081 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HARSP12081 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HARSP12081 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HARSP12081 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HARSP12081 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HARSP12081 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HARSP12081 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HARSP12081 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HARSP12081 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HARSP12081 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HARSP12081 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HARSP12081 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HARSP12081 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HARSP12081 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HARSP12081 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HARSP12081 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HARSP12081 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HARSP12081 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HARSP12081 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HARSP12081 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HARSP12081 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HARSP12081 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HARSP12081 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HARSP12081 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HARSP12081 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HARSP12081 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HARSP12081 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HARSP12081 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HARSP12081 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HARSP12081 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HARSP12081 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HARSP12081 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HARSP12081 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HARSP12081 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HARSP12081 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HARSP12081 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HARSP12081 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HARSP12081 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HARSP12081 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HARSP12081 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HARSP12081 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HARSP12081 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HARSP12081 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HARSP12081 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HARSP12081 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HARSP12081 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HARSP12081 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HARSP12081 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HARSP12081 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HARSP12081 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HARSP12081 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HARSP12081 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HARSP12081 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HARSP12081 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HARSP12081 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HARSP12081 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HARSP12081 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HARSP12081 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HARSP12081 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HARSP12081 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HARSP12081 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HARSP12081 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HARSP12081 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HARSP12081 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HARSP12081 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HARSP12081 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HARSP12081 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HARSP12081 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HARSP12081 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HARSP12081 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms