Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COX6A1P12074 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COX6A1P12074 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms