Protein–RNA interactions for Protein: P10643

C7, Complement component C7, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7P10643 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C7P10643 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C7P10643 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C7P10643 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C7P10643 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C7P10643 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C7P10643 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C7P10643 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C7P10643 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C7P10643 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C7P10643 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C7P10643 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C7P10643 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C7P10643 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C7P10643 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C7P10643 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C7P10643 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C7P10643 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
C7P10643 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C7P10643 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C7P10643 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C7P10643 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C7P10643 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C7P10643 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C7P10643 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C7P10643 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C7P10643 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C7P10643 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
C7P10643 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
C7P10643 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C7P10643 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C7P10643 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C7P10643 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C7P10643 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C7P10643 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C7P10643 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C7P10643 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C7P10643 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C7P10643 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C7P10643 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C7P10643 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C7P10643 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C7P10643 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C7P10643 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C7P10643 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C7P10643 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C7P10643 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C7P10643 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C7P10643 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C7P10643 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C7P10643 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C7P10643 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C7P10643 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C7P10643 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C7P10643 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C7P10643 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C7P10643 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C7P10643 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C7P10643 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C7P10643 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C7P10643 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C7P10643 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C7P10643 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C7P10643 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C7P10643 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C7P10643 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C7P10643 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C7P10643 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C7P10643 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms