Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTPRFP10586 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRFP10586 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRFP10586 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms