Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
APELAP0DMC3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APELAP0DMC3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms