Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD1P0DJD0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD1P0DJD0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD1P0DJD0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms