Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
C4BP0C0L5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
C4BP0C0L5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
C4BP0C0L5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms