Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VIL1P09327 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VIL1P09327 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VIL1P09327 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VIL1P09327 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VIL1P09327 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VIL1P09327 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VIL1P09327 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VIL1P09327 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VIL1P09327 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VIL1P09327 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VIL1P09327 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VIL1P09327 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VIL1P09327 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VIL1P09327 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VIL1P09327 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VIL1P09327 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VIL1P09327 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VIL1P09327 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VIL1P09327 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VIL1P09327 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VIL1P09327 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VIL1P09327 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VIL1P09327 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VIL1P09327 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VIL1P09327 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VIL1P09327 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VIL1P09327 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VIL1P09327 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VIL1P09327 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VIL1P09327 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VIL1P09327 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VIL1P09327 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VIL1P09327 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VIL1P09327 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VIL1P09327 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VIL1P09327 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VIL1P09327 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VIL1P09327 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIL1P09327 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIL1P09327 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIL1P09327 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIL1P09327 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIL1P09327 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIL1P09327 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VIL1P09327 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIL1P09327 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIL1P09327 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIL1P09327 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIL1P09327 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIL1P09327 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIL1P09327 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIL1P09327 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VIL1P09327 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VIL1P09327 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VIL1P09327 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VIL1P09327 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VIL1P09327 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
VIL1P09327 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VIL1P09327 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
VIL1P09327 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
VIL1P09327 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VIL1P09327 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VIL1P09327 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VIL1P09327 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VIL1P09327 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VIL1P09327 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VIL1P09327 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VIL1P09327 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VIL1P09327 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VIL1P09327 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VIL1P09327 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VIL1P09327 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VIL1P09327 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIL1P09327 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIL1P09327 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIL1P09327 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIL1P09327 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIL1P09327 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIL1P09327 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIL1P09327 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIL1P09327 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIL1P09327 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIL1P09327 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
VIL1P09327 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIL1P09327 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIL1P09327 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VIL1P09327 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VIL1P09327 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VIL1P09327 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VIL1P09327 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VIL1P09327 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VIL1P09327 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VIL1P09327 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VIL1P09327 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VIL1P09327 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VIL1P09327 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VIL1P09327 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VIL1P09327 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VIL1P09327 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms