Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MGPP08493 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MGPP08493 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGPP08493 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGPP08493 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGPP08493 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGPP08493 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGPP08493 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MGPP08493 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MGPP08493 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGPP08493 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGPP08493 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGPP08493 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGPP08493 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGPP08493 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGPP08493 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGPP08493 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGPP08493 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGPP08493 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGPP08493 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGPP08493 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGPP08493 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGPP08493 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGPP08493 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MGPP08493 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MGPP08493 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms