Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA4P06727 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA4P06727 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOA4P06727 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA4P06727 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
APOA4P06727 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA4P06727 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA4P06727 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA4P06727 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA4P06727 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA4P06727 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA4P06727 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA4P06727 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA4P06727 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA4P06727 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOA4P06727 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA4P06727 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA4P06727 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA4P06727 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA4P06727 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA4P06727 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA4P06727 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA4P06727 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA4P06727 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA4P06727 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA4P06727 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA4P06727 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA4P06727 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA4P06727 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA4P06727 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOA4P06727 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA4P06727 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA4P06727 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA4P06727 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA4P06727 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA4P06727 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA4P06727 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA4P06727 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA4P06727 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA4P06727 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA4P06727 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA4P06727 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA4P06727 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA4P06727 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOA4P06727 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA4P06727 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA4P06727 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA4P06727 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA4P06727 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA4P06727 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA4P06727 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA4P06727 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA4P06727 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA4P06727 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA4P06727 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA4P06727 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA4P06727 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA4P06727 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA4P06727 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOA4P06727 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOA4P06727 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOA4P06727 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
APOA4P06727 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA4P06727 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA4P06727 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA4P06727 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA4P06727 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA4P06727 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA4P06727 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA4P06727 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA4P06727 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA4P06727 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOA4P06727 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOA4P06727 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOA4P06727 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms