Protein–RNA interactions for Protein: P05549

TFAP2A, Transcription factor AP-2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2AP05549 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TFAP2AP05549 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAP2AP05549 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAP2AP05549 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TFAP2AP05549 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2AP05549 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2AP05549 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2AP05549 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2AP05549 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2AP05549 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2AP05549 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2AP05549 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2AP05549 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TFAP2AP05549 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms