Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APODP05090 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APODP05090 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APODP05090 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APODP05090 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APODP05090 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APODP05090 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APODP05090 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APODP05090 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APODP05090 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APODP05090 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APODP05090 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APODP05090 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APODP05090 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APODP05090 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APODP05090 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APODP05090 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APODP05090 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APODP05090 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APODP05090 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APODP05090 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APODP05090 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APODP05090 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APODP05090 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APODP05090 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APODP05090 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APODP05090 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APODP05090 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
APODP05090 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APODP05090 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APODP05090 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APODP05090 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APODP05090 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APODP05090 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APODP05090 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APODP05090 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APODP05090 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APODP05090 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APODP05090 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APODP05090 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APODP05090 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APODP05090 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APODP05090 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APODP05090 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APODP05090 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APODP05090 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APODP05090 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APODP05090 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APODP05090 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APODP05090 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APODP05090 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APODP05090 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APODP05090 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APODP05090 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APODP05090 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APODP05090 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APODP05090 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APODP05090 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APODP05090 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APODP05090 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APODP05090 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APODP05090 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APODP05090 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APODP05090 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APODP05090 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APODP05090 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APODP05090 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APODP05090 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APODP05090 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APODP05090 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APODP05090 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APODP05090 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APODP05090 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APODP05090 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APODP05090 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APODP05090 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APODP05090 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APODP05090 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APODP05090 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APODP05090 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APODP05090 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APODP05090 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APODP05090 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APODP05090 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APODP05090 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APODP05090 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APODP05090 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APODP05090 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APODP05090 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APODP05090 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APODP05090 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APODP05090 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APODP05090 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APODP05090 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APODP05090 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APODP05090 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APODP05090 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
APODP05090 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APODP05090 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APODP05090 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms