Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNNC2P02585 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNNC2P02585 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms