Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IGKV1-17P01599 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IGKV1-17P01599 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms