Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX58O95786 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX58O95786 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX58O95786 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX58O95786 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DDX58O95786 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX58O95786 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX58O95786 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX58O95786 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX58O95786 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX58O95786 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX58O95786 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX58O95786 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX58O95786 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DDX58O95786 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX58O95786 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DDX58O95786 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX58O95786 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX58O95786 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX58O95786 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX58O95786 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX58O95786 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX58O95786 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX58O95786 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX58O95786 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX58O95786 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX58O95786 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX58O95786 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX58O95786 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX58O95786 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX58O95786 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DDX58O95786 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX58O95786 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX58O95786 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX58O95786 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX58O95786 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX58O95786 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX58O95786 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX58O95786 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX58O95786 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX58O95786 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DDX58O95786 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX58O95786 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX58O95786 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX58O95786 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX58O95786 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX58O95786 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX58O95786 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX58O95786 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX58O95786 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DDX58O95786 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
DDX58O95786 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX58O95786 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX58O95786 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX58O95786 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX58O95786 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX58O95786 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX58O95786 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX58O95786 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX58O95786 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DDX58O95786 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX58O95786 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX58O95786 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX58O95786 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX58O95786 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX58O95786 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX58O95786 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX58O95786 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX58O95786 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX58O95786 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DDX58O95786 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX58O95786 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX58O95786 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX58O95786 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX58O95786 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX58O95786 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX58O95786 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DDX58O95786 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX58O95786 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX58O95786 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX58O95786 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX58O95786 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX58O95786 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX58O95786 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX58O95786 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX58O95786 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX58O95786 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DDX58O95786 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX58O95786 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX58O95786 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX58O95786 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX58O95786 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX58O95786 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX58O95786 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX58O95786 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX58O95786 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX58O95786 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX58O95786 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX58O95786 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DDX58O95786 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms