Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
POLR1AO95602 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
POLR1AO95602 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
POLR1AO95602 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms