Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP2O95045 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP2O95045 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP2O95045 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP2O95045 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP2O95045 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP2O95045 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP2O95045 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP2O95045 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP2O95045 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UPP2O95045 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP2O95045 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP2O95045 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP2O95045 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP2O95045 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP2O95045 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP2O95045 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP2O95045 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP2O95045 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP2O95045 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP2O95045 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP2O95045 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP2O95045 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UPP2O95045 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP2O95045 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP2O95045 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP2O95045 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP2O95045 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP2O95045 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP2O95045 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP2O95045 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP2O95045 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP2O95045 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP2O95045 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP2O95045 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP2O95045 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP2O95045 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UPP2O95045 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP2O95045 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP2O95045 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP2O95045 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP2O95045 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP2O95045 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP2O95045 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP2O95045 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP2O95045 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP2O95045 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP2O95045 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP2O95045 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UPP2O95045 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24■■□□□ 1.43
UPP2O95045 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPP2O95045 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UPP2O95045 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UPP2O95045 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP2O95045 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP2O95045 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP2O95045 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP2O95045 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP2O95045 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP2O95045 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP2O95045 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP2O95045 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP2O95045 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP2O95045 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP2O95045 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UPP2O95045 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP2O95045 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP2O95045 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP2O95045 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP2O95045 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP2O95045 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP2O95045 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP2O95045 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP2O95045 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UPP2O95045 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP2O95045 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP2O95045 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP2O95045 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP2O95045 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP2O95045 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP2O95045 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP2O95045 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP2O95045 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP2O95045 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP2O95045 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UPP2O95045 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP2O95045 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP2O95045 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP2O95045 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP2O95045 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP2O95045 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP2O95045 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP2O95045 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP2O95045 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP2O95045 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP2O95045 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP2O95045 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP2O95045 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UPP2O95045 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UPP2O95045 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms