Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLSTN1O94985 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSTN1O94985 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms