Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SLIT2O94813 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SLIT2O94813 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLIT2O94813 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms