Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM2O94769 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM2O94769 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM2O94769 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM2O94769 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM2O94769 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ECM2O94769 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM2O94769 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM2O94769 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM2O94769 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM2O94769 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM2O94769 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM2O94769 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM2O94769 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ECM2O94769 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM2O94769 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM2O94769 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM2O94769 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM2O94769 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM2O94769 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM2O94769 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM2O94769 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM2O94769 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM2O94769 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM2O94769 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ECM2O94769 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM2O94769 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM2O94769 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM2O94769 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM2O94769 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM2O94769 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM2O94769 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM2O94769 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM2O94769 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ECM2O94769 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECM2O94769 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECM2O94769 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECM2O94769 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECM2O94769 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECM2O94769 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECM2O94769 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECM2O94769 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECM2O94769 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ECM2O94769 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM2O94769 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM2O94769 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM2O94769 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM2O94769 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM2O94769 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM2O94769 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM2O94769 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM2O94769 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM2O94769 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM2O94769 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM2O94769 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ECM2O94769 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM2O94769 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM2O94769 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM2O94769 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM2O94769 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM2O94769 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM2O94769 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM2O94769 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM2O94769 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM2O94769 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM2O94769 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM2O94769 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM2O94769 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM2O94769 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM2O94769 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ECM2O94769 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM2O94769 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM2O94769 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM2O94769 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM2O94769 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM2O94769 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM2O94769 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM2O94769 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM2O94769 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM2O94769 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM2O94769 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ECM2O94769 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM2O94769 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM2O94769 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM2O94769 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM2O94769 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM2O94769 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM2O94769 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM2O94769 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM2O94769 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ECM2O94769 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM2O94769 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM2O94769 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM2O94769 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM2O94769 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM2O94769 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM2O94769 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ECM2O94769 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM2O94769 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ECM2O94769 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms