Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RASSF9O75901 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RASSF9O75901 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms