Protein–RNA interactions for Protein: O75608

LYPLA1, Acyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPLA1O75608 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LYPLA1O75608 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LYPLA1O75608 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms