Protein–RNA interactions for Protein: O75534

CSDE1, Cold shock domain-containing protein E1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1O75534 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSDE1O75534 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSDE1O75534 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms