Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN2O75298 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN2O75298 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN2O75298 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN2O75298 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN2O75298 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN2O75298 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN2O75298 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN2O75298 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN2O75298 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN2O75298 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN2O75298 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RTN2O75298 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN2O75298 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN2O75298 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN2O75298 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN2O75298 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN2O75298 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN2O75298 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN2O75298 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN2O75298 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN2O75298 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RTN2O75298 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN2O75298 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN2O75298 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN2O75298 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN2O75298 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN2O75298 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN2O75298 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN2O75298 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN2O75298 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN2O75298 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN2O75298 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RTN2O75298 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN2O75298 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN2O75298 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN2O75298 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN2O75298 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RTN2O75298 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN2O75298 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN2O75298 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN2O75298 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN2O75298 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN2O75298 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN2O75298 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN2O75298 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RTN2O75298 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RTN2O75298 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN2O75298 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN2O75298 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN2O75298 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN2O75298 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN2O75298 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN2O75298 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN2O75298 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RTN2O75298 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN2O75298 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN2O75298 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN2O75298 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN2O75298 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN2O75298 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN2O75298 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN2O75298 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN2O75298 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN2O75298 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN2O75298 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN2O75298 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN2O75298 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN2O75298 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RTN2O75298 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN2O75298 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN2O75298 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN2O75298 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN2O75298 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN2O75298 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN2O75298 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN2O75298 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN2O75298 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN2O75298 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN2O75298 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RTN2O75298 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms