Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIN3BO75182 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIN3BO75182 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms