Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAB11FIP3O75154 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAB11FIP3O75154 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAB11FIP3O75154 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms