Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FOXD2O60548 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FOXD2O60548 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms