Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NOBOXO60393 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NOBOXO60393 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NOBOXO60393 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms