Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NUPR1O60356 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NUPR1O60356 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms