Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP9BO43861 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP9BO43861 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms