Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALUO43852 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALUO43852 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CALUO43852 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALUO43852 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALUO43852 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALUO43852 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALUO43852 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALUO43852 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CALUO43852 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALUO43852 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALUO43852 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALUO43852 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALUO43852 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALUO43852 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALUO43852 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALUO43852 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CALUO43852 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CALUO43852 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALUO43852 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALUO43852 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CALUO43852 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALUO43852 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALUO43852 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALUO43852 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALUO43852 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALUO43852 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CALUO43852 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALUO43852 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALUO43852 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CALUO43852 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALUO43852 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CALUO43852 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALUO43852 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALUO43852 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CALUO43852 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALUO43852 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALUO43852 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALUO43852 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALUO43852 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALUO43852 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALUO43852 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALUO43852 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALUO43852 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALUO43852 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALUO43852 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALUO43852 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALUO43852 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CALUO43852 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALUO43852 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CALUO43852 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALUO43852 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALUO43852 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALUO43852 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALUO43852 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALUO43852 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALUO43852 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALUO43852 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALUO43852 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALUO43852 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CALUO43852 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CALUO43852 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALUO43852 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALUO43852 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALUO43852 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALUO43852 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALUO43852 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CALUO43852 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALUO43852 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CALUO43852 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALUO43852 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALUO43852 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALUO43852 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALUO43852 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALUO43852 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALUO43852 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CALUO43852 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALUO43852 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALUO43852 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALUO43852 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALUO43852 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALUO43852 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALUO43852 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALUO43852 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CALUO43852 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms