Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYNGR3O43761 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SYNGR3O43761 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms