Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF14O43557 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF14O43557 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFSF14O43557 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFSF14O43557 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNFSF14O43557 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF14O43557 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF14O43557 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF14O43557 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF14O43557 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF14O43557 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF14O43557 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF14O43557 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF14O43557 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms